這是宮崎駿最近期的一部作品，據說片中的男主人公宗介就是以他自己的大兒子宮崎吾郎為原型創作的。這裡也有宮崎駿家鄉日本鄉間的許多風景和人物故事。
影片故事的背景是一個日本臨海的地方，在海邊懸崖上住著一戶人家，宗介和他的媽媽。而他的爸爸是海上某條漁船的船長。小宗介無意中救了一條人面小金魚，並給它起名叫做“波妞”。宗介與小金魚之間應該是建立了比較好的友誼。宗介好好的照顧著小金魚，小金魚便喜歡上了宗介。波妞有著神奇的魔力，還有一個在海裡生活著的神秘人形父親。後來知道這紅髮男子原來以前也是人類，可能有點環境保護意識，就背離人類，並且住到了海裡。他與海洋之母結合生下了波妞和一群小金魚。
我只認為是讓自己能夠在其中回想起好多兒時的事。大海一直就是夢幻的所在，而大家從小便都聽過“海的女兒”的故事，所以不會對這懸崖上的金魚姬感到陌生。只是大家會好奇怎麼故事的主人公會這麼小，看起來他們之間應當只是我們小時候覺得的會有的對自己喜歡的東西偏執的佔有慾，而不會產生那樣的王子與人魚公主之間淒美的愛情呀。
波妞被父親抓了回去，因為是曾經舔過小宗介的血，所以波妞能夠掙扎著努力著就變成了有手、有腳的魚。雖然有些醜，手腳只有三個指頭，臉也是青蛙臉。這不免使觀眾擔心，這麼醜的外表，即使心靈無暇，會不會把宗介嚇到。這樣之間怎麼會產生美好的感情，即使產生了，也讓人覺得彆扭。好在波妞在宗介面前出現的時候的樣子都是與宗介差不多大的小女生。
波妞想著要找到宗介，卻沒想到給人類造成了一場大風暴，風暴造成的大洪水淹沒了附近的村莊。有又演繹了一段勢要找到自己所喜歡的人的故事。最終波妞與宗介得以相見，過起了人類的日子。後來波妞的母親海洋之母出現，由她決定是讓波妞回來，還是讓波妞失去魔法變成人類的小女孩？海洋之母決定對波妞實施一個古老的魔法，是變成人類，還是變成泡沫，就看宗介是否變心了。只要宗介給跟他上岸的波妞一吻，波妞就會永遠變成一個小女孩。
只是為什麼要將小金魚幻化成人形呢？是什麼力量使得波妞能夠堅持著找到宗介，又是什麼力量使得宗介能夠認同小金魚幻化成人形？宗介當初不是像所有小孩一樣只把她當成一個小寵物嗎？我們可以說王子與公主之間是為了愛情。那難道宗介與波妞之間是為了期待那十幾年後的愛情，況且要讓四五歲的小孩懂得愛情，這無論如何都讓人覺得彆扭。當然宗介與波妞一吻，在了一起。雖然不知道數十年後會怎麼樣，但在這一刻確實美好。這故事也是許多看了童話故事之後的小孩，都會做的一個夢，總是希望著自己會遇上這麼稀奇的事。然後是自己與眾不同，向其他的小夥伴炫耀自己的神奇的新朋友。只是宗介與波妞永遠在了一起。
其實縱觀宮崎駿這麼多動畫電影，有時是真的太過於藝術上的華麗了，做了那麼多精美的藝術的東西，讓人感覺這麼複雜、眼花繚亂，這恐怕也只有日本人才消受得了。不過總歸會讓人覺得失去一種純真和樸素。這個人魚故事應當是很民間的，卻被他提到很高的藝術高度，讓人無法接受。而確實宮崎駿電影會一時間出現那麼多迷人感官的東西。而那麼多種的雜揉，人是很容易會被迷惑，很容易自以為是的。